21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3174 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  64.34 
 
 
272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  55.19 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  53.85 
 
 
274 aa  275  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  49.28 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  54.58 
 
 
265 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  50.72 
 
 
267 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  39.26 
 
 
279 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  38.11 
 
 
238 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  37.68 
 
 
279 aa  168  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  38.1 
 
 
274 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  38.83 
 
 
278 aa  165  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  33.03 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  28.52 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  28.01 
 
 
296 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  30.8 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  28.33 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  31.13 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  26.24 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0406  hypothetical protein  22.96 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2259  hypothetical protein  24.29 
 
 
260 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0386104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>