21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2519 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12027  hypothetical protein  32.9 
 
 
255 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000558386  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1323  hypothetical protein  30.6 
 
 
235 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1456  hypothetical protein  32.47 
 
 
206 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0103956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1641  hypothetical protein  27.66 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3104  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.72 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 
177 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.54 
 
 
191 aa  48.5  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.15 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  26.11 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.29 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.14 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0547  hemerythrin HHE cation binding protein  29.46 
 
 
178 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.184109  normal  0.0988011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.84 
 
 
176 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  25.56 
 
 
193 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  24.24 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 
198 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  22.15 
 
 
180 aa  42.4  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.71 
 
 
187 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3857  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.43 
 
 
199 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.75 
 
 
180 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>