12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0034 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0034  plasmid segregation protein ParM  100 
 
 		 326 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0737307 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0018  plasmid segregation protein ParM  65.64 
 
 		 326 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.419882  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0008  plasmid segregation protein ParM  52.52 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2664  plasmid segregation protein ParM  51.41 
 
 		 319 aa  318  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301263 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0013  plasmid segregation protein ParM  38.39 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0234  plasmid segregation protein ParM  38.87 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3447  StbA family protein  35.67 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.978374  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3561  StbA family protein  34.7 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1926  plasmid segregation protein ParM  46.73 
 
 		 205 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.272458  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4278  StbA family protein  23.28 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0106  plasmid stability protein StbA family protein  23.4 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  28.48 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>