48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2110 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  100 
 
 		 1222 aa  2460    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  45.27 
 
 		 1058 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1108 aa  335  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1154 aa  328  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1120 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  36.71 
 
 		 1068 aa  326  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1148 aa  325  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  39.87 
 
 		 1164 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  40.58 
 
 		 1070 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  40.36 
 
 		 1066 aa  322  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1086 aa  315  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  34.06 
 
 		 1205 aa  278  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1134 aa  262  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  34.16 
 
 		 1104 aa  253  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  38.25 
 
 		 1100 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  43.4 
 
 		 1307 aa  224  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  33.71 
 
 		 863 aa  105  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  30.48 
 
 		 860 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  27.09 
 
 		 882 aa  84.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  31.54 
 
 		 673 aa  83.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  29.83 
 
 		 854 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  29.41 
 
 		 847 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  29.03 
 
 		 712 aa  69.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  28.25 
 
 		 863 aa  68.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  31.41 
 
 		 891 aa  66.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  27.17 
 
 		 702 aa  62  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  26.16 
 
 		 857 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  27.7 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  28.77 
 
 		 888 aa  58.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  27.53 
 
 		 863 aa  57  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  29.41 
 
 		 707 aa  53.5  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  30.36 
 
 		 688 aa  51.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2264  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0095574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2003  hypothetical protein  30.17 
 
 		 879 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1619  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  50.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1770  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2274  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01366  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2599  hypothetical protein  29.19 
 
 		 870 aa  50.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1566  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1468  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01353  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2591  hypothetical protein  26.52 
 
 		 863 aa  48.9  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1780  hypothetical protein  26.01 
 
 		 867 aa  48.9  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1943  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  46.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00013464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1919  hypothetical protein  27.53 
 
 		 904 aa  45.8  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2213  hypothetical protein  27.53 
 
 		 898 aa  45.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1809  hypothetical protein  27.53 
 
 		 910 aa  45.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>