122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1633 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  60.36 
 
 		 171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  58.18 
 
 		 172 aa  210  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  58.9 
 
 		 175 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  58.9 
 
 		 175 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  57.99 
 
 		 169 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  58.9 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  58.28 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  58.28 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  57.06 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  57.06 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  54.6 
 
 		 188 aa  203  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  57.58 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  58.18 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  55.83 
 
 		 175 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  55.76 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  45.45 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  46.39 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  44.81 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  44.58 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  44.58 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  47.74 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  45.45 
 
 		 178 aa  147  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  45.45 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  45.45 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  45.45 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  45.45 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  45.45 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  45.45 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  46.05 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  46.11 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  47.34 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  44.81 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  45.95 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  41.28 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  43.93 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  45.95 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  45.95 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  45.95 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  45.45 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  43.2 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  45.64 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  47.06 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  48.82 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  40 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  50 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  42.44 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  37.8 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  38.22 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  37.58 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4024  disulphide bond formation protein DsbB  32.56 
 
 		 211 aa  94.4  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4029  disulphide bond formation protein DsbB  31.4 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0235  disulfide bond formation protein  30.29 
 
 		 211 aa  87.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3870  disulfide bond formation protein  30.23 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4000  disulfide bond formation protein  26.75 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3335  putative disulfide oxidoreductase  35.17 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0003  putative disulfide oxidoreductase  29.34 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0434  putative disulfide oxidoreductase  27.51 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.679681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3380  putative disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3547  putative disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.668443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3375  putative disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3452  putative disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3445  putative disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1146  putative disulfide oxidoreductase  31.43 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1014  putative disulfide oxidoreductase  30.94 
 
 		 261 aa  67  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00012022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  31.17 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0881  putative disulfide oxidoreductase  30.37 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.554065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0952  putative disulfide oxidoreductase  30.94 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.147745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  32.43 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  31.06 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  29.41 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  30.61 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  26.71 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  30.07 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1381  putative disulfide oxidoreductase  31.78 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  normal  0.0714776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1437  putative disulfide oxidoreductase  31.78 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  31.79 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  29.14 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  32.03 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  26.57 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  27.78 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  29.73 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  30.07 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  29.25 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.23 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  28.67 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  27.74 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  24.64 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1623  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  25.57 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  30.6 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  30.99 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  27.34 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  27.78 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  27.34 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  29.13 
 
 		 1210 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  26.06 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  29.13 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  28.12 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>