More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0208 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 		 168 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  86.31 
 
 		 168 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.57 
 
 		 163 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.57 
 
 		 163 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.57 
 
 		 163 aa  298  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  88.2 
 
 		 163 aa  294  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.81 
 
 		 158 aa  293  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4684  phosphopantetheine adenylyltransferase  93.38 
 
 		 163 aa  291  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  91.08 
 
 		 159 aa  291  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4471  phosphopantetheine adenylyltransferase  93.38 
 
 		 163 aa  290  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.24 
 
 		 158 aa  288  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4331  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.72 
 
 		 163 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4276  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.72 
 
 		 163 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0068  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.05 
 
 		 163 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0110  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  87.5 
 
 		 189 aa  284  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.800905  normal  0.0383495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  86.62 
 
 		 158 aa  280  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0053  phosphopantetheine adenylyltransferase  75.95 
 
 		 160 aa  255  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00059  phosphopantetheine adenylyltransferase  75.47 
 
 		 162 aa  252  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0213  phosphopantetheine adenylyltransferase  79.47 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.52 
 
 		 159 aa  224  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.18 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.74 
 
 		 159 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.1 
 
 		 161 aa  220  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.1 
 
 		 159 aa  220  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4838  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.5 
 
 		 161 aa  220  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000302126  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.1 
 
 		 160 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.87 
 
 		 159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  65.81 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.81 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.81 
 
 		 159 aa  217  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  65.41 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2603  phosphopantetheine adenylyltransferase  69.48 
 
 		 164 aa  216  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000855296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.16 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.82 
 
 		 160 aa  214  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.92 
 
 		 159 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00659  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.69 
 
 		 159 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001814  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.03 
 
 		 161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313981  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.92 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4385  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.56 
 
 		 163 aa  208  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 		 159 aa  207  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4095  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 		 159 aa  205  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277222  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0065  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.26 
 
 		 159 aa  204  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4151  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.26 
 
 		 159 aa  204  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000257789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.26 
 
 		 159 aa  204  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  61.15 
 
 		 159 aa  203  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.46 
 
 		 164 aa  202  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  62.34 
 
 		 160 aa  200  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.01 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0548  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  58.97 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2935  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.04 
 
 		 167 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.75 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.69 
 
 		 165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  57.23 
 
 		 181 aa  194  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.88 
 
 		 167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.88 
 
 		 167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.6 
 
 		 164 aa  192  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1924  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.33 
 
 		 165 aa  193  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.77 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.564198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.42 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0564  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00247535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3125  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0748  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.82241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0469  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2925  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4138  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.94 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0093  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1497  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0494  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2725  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.284056  normal  0.758583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2867  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.77 
 
 		 161 aa  191  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.94 
 
 		 171 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  54.72 
 
 		 170 aa  190  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.41 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.97 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.75 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0609  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.41 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.41 
 
 		 170 aa  188  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.44 
 
 		 169 aa  187  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0310  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.43 
 
 		 168 aa  186  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.78 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2807  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.78 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.78 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2006  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  56.6 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  58.82 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>