18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0087 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0087  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2679  hypothetical protein  81.3 
 
 		 123 aa  213  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3070  hypothetical protein  56.1 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0228589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1435  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.74 
 
 		 123 aa  151  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6190  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.2 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2990  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.85 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0674321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0312  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.59 
 
 		 123 aa  137  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03304  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.15 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.276321  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0348  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.48 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.913707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2765  fosfomycin resistance protein  26.67 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000231179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2546  fosfomycin resistance protein  26.36 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.658002  hitchhiker  0.00000000325933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3444  CopG/DNA-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.430101  normal  0.0328627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2746  fosfomycin resistance protein  25.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.876802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2789  fosfomycin resistance protein  27.34 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000015113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2019  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.45 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448415  normal  0.510288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2468  fosfomycin resistance protein  27.34 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.484363  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1827  ring-cleaving dioxygenase  25.89 
 
 		 150 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1600  CopG/DNA-binding domain-containing protein  28.04 
 
 		 189 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>