178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3129 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  100 
 
 		 150 aa  312  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  56.21 
 
 		 153 aa  173  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  56.21 
 
 		 153 aa  173  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  52.03 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  55.56 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  56.25 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  53.95 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  53.59 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  53.59 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  53.59 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  53.59 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2323  hypothetical protein  54.61 
 
 		 155 aa  166  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300007  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1030  protein of unknown function DUF55  54.36 
 
 		 160 aa  166  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  53.59 
 
 		 153 aa  166  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  57.04 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  53.95 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0843  hypothetical protein  54.73 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  53.38 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0961  hypothetical protein  54.05 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  51.35 
 
 		 152 aa  163  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01784  hypothetical protein  52.29 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.280348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  51.66 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  49.02 
 
 		 158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0781  protein of unknown function DUF55  49.67 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0209669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  49.67 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02383  hypothetical protein  54.05 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  49.67 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  52.03 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3282  protein of unknown function DUF55  53.33 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0784521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  48.34 
 
 		 154 aa  153  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2403  hypothetical protein  52.38 
 
 		 168 aa  152  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  56.12 
 
 		 189 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  50.99 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0651  hypothetical protein  54.35 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2217  hypothetical protein  53.52 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0831  hypothetical protein  54.19 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2149  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0836  hypothetical protein  53.02 
 
 		 194 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1521  hypothetical protein  48.95 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0365947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  49.66 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2948  hypothetical protein  46.31 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  48 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2212  protein of unknown function DUF55  51.02 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  48 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0992  protein of unknown function DUF55  54.93 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2135  protein of unknown function DUF55  48.34 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2792  hypothetical protein  52.9 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.495937 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2330  hypothetical protein  53.55 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0213902  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18281  hypothetical protein  48.55 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2956  hypothetical protein  53.55 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2670  protein of unknown function DUF55  50.34 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1642  hypothetical protein  53.55 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1184  hypothetical protein  53.55 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  44.37 
 
 		 152 aa  147  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0953  hypothetical protein  47.95 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1025  hypothetical protein  52.9 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000631398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1032  hypothetical protein  52.9 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5031  hypothetical protein  49.67 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  44.37 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  47.06 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0960  hypothetical protein  48.55 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0523  hypothetical protein  46.58 
 
 		 156 aa  146  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  47.68 
 
 		 152 aa  146  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15461  hypothetical protein  46.58 
 
 		 156 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.439189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  48.2 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  50.35 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4320  protein of unknown function DUF55  48.63 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000124301  hitchhiker  0.00573912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2463  hypothetical protein  54.23 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.563467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1847  hypothetical protein  54.23 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4260  protein of unknown function DUF55  48.63 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  49.33 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2458  hypothetical protein  54.23 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2507  hypothetical protein  54.23 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2375  hypothetical protein  54.23 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5789  hypothetical protein  53.52 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  46.36 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16181  hypothetical protein  50.35 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  48.99 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16301  hypothetical protein  48.94 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2669  hypothetical protein  53.62 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  48 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0190  protein of unknown function DUF55  47.59 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.450545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2927  hypothetical protein  52.86 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2154  hypothetical protein  46.81 
 
 		 148 aa  141  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.694914  normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  45.1 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1167  hypothetical protein  46.04 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0155803  normal  0.011796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4934  protein of unknown function DUF55  48.32 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  47.68 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  47.59 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16061  hypothetical protein  49.65 
 
 		 155 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4026  hypothetical protein  47.89 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1663  protein of unknown function DUF55  52.55 
 
 		 159 aa  139  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2092  hypothetical protein  52.55 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2834  hypothetical protein  48.97 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4432  hypothetical protein  43.84 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.830647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  47.65 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3514  hypothetical protein  50.35 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  44.59 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>