18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1319 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1319  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  235  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.181479  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3058  hypothetical protein  99.12 
 
 
114 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0202698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3201  hypothetical protein  99.12 
 
 
114 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.50752  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3044  hypothetical protein  99.12 
 
 
114 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2705  hypothetical protein  92.98 
 
 
114 aa  224  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00514172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3374  hypothetical protein  85.09 
 
 
114 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1176  hypothetical protein  84.21 
 
 
114 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0641915  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1175  hypothetical protein  83.33 
 
 
114 aa  208  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166401  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1246  hypothetical protein  83.33 
 
 
114 aa  207  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1109  hypothetical protein  77.19 
 
 
114 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249921  normal  0.981627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1039  hypothetical protein  75.44 
 
 
114 aa  191  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0141429  normal  0.686037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2654  hypothetical protein  71.05 
 
 
114 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000435308  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0961  hypothetical protein  71.93 
 
 
114 aa  186  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199387  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0931  hypothetical protein  72.81 
 
 
114 aa  170  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3027  hypothetical protein  66.67 
 
 
114 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00221718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3035  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1088  hypothetical protein  29.87 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003446  hypothetical protein  25.26 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00494887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>