16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003446 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003446  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00494887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02329  hypothetical protein  85.44 
 
 		 103 aa  190  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1088  hypothetical protein  73.4 
 
 		 110 aa  156  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1175  hypothetical protein  25.53 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1176  hypothetical protein  25.53 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0641915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1246  hypothetical protein  25.53 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3374  hypothetical protein  25.53 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2705  hypothetical protein  24.74 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00514172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1033  hypothetical protein  32.84 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323676  normal  0.817126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3058  hypothetical protein  25.26 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0202698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3201  hypothetical protein  25.26 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.50752  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1109  hypothetical protein  26.53 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249921  normal  0.981627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0931  hypothetical protein  28.77 
 
 		 114 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3035  hypothetical protein  26.92 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1039  hypothetical protein  27.4 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0141429  normal  0.686037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1319  hypothetical protein  25.26 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.181479  normal  0.0476829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>