18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1088 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1088  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  225  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003446  hypothetical protein  73.4 
 
 		 103 aa  156  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00494887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02329  hypothetical protein  71.28 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1175  hypothetical protein  27 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1109  hypothetical protein  30.93 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249921  normal  0.981627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1176  hypothetical protein  27 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0641915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1246  hypothetical protein  27 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2705  hypothetical protein  25 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00514172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3374  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3058  hypothetical protein  25 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0202698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3201  hypothetical protein  25 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.50752  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1319  hypothetical protein  29.87 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.181479  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0961  hypothetical protein  29.59 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1039  hypothetical protein  32.89 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0141429  normal  0.686037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3044  hypothetical protein  29.87 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.511414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3035  hypothetical protein  30.14 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2654  hypothetical protein  26.67 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000435308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0931  hypothetical protein  30.99 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>