26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0837 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3523  hypothetical protein  97.39 
 
 
384 aa  771    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0015438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0844  hypothetical protein  97.43 
 
 
389 aa  783    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0812  hypothetical protein  98.2 
 
 
389 aa  788    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000162038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0837  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  801    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.240462  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3158  hypothetical protein  94.81 
 
 
384 aa  753    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0013201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3441  hypothetical protein  86.75 
 
 
385 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00415893  normal  0.25947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3329  hypothetical protein  87.01 
 
 
385 aa  701    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0693  hypothetical protein  87.27 
 
 
385 aa  705    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226756  normal  0.897132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0835  hypothetical protein  83.38 
 
 
385 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4131  hypothetical protein  64.05 
 
 
388 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0130576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0603  hypothetical protein  66.67 
 
 
386 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3969  hypothetical protein  63.06 
 
 
390 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0578  hypothetical protein  65.56 
 
 
385 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.056117  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0546  hypothetical protein  59.75 
 
 
394 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3221  hypothetical protein  66.48 
 
 
386 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0332861  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2971  hypothetical protein  59.44 
 
 
399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0733  hypothetical protein  45.11 
 
 
391 aa  311  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4467  secreted protein  35.98 
 
 
423 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207667  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1934  hypothetical protein  31.67 
 
 
364 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2682  hypothetical protein  29.46 
 
 
453 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2117  secreted protein  30.92 
 
 
415 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2869  hypothetical protein  27.29 
 
 
537 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00620  hypothetical protein  28.22 
 
 
553 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486509  normal  0.628936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0052  hypothetical protein  27.25 
 
 
553 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6996  hypothetical protein  32.81 
 
 
500 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17670  hypothetical protein  39.19 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.276623  normal  0.654681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>