297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_R0015 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.69215e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  9.33808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.78716e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0024  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.158579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0051  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000340535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0097  tRNA-Pro  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.21345e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0071  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0573  tRNA-Pro  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0063  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R20  tRNA-Pro  97.01 
 
 
77 bp  117  4e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.01894e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  94.59 
 
 
79 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.71515e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.42912e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.01442e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.93186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.04874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.81593e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.23661e-11  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.05967e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  94.59 
 
 
79 bp  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.815519 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.92885e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  6.58436e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  94.59 
 
 
80 bp  115  1e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.60288e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.47128e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.84073e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.29612e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.61366e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.62002e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.82088e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  2.06578e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.71561e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.95724e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  5.68305e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  9.60142e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  94.59 
 
 
77 bp  115  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  94.59 
 
 
80 bp  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.17481e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  94.59 
 
 
80 bp  115  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.44248e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0042  tRNA-Pro  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0021  tRNA-Pro  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt024  tRNA-Pro  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000181735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  95.24 
 
 
77 bp  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  6.28165e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0029  tRNA-Pro  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0741  tRNA-Pro  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0090  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309277  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  5e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.203232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  5e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0040  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  5e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0081  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  5e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0096  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  5e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1222  tRNA-Pro  92.86 
 
 
74 bp  79.8  8e-14  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.335805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  91.53 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4652  tRNA-Pro  92.73 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0301186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4650  tRNA-Pro  92.73 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3790  tRNA-Pro  92.73 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3787  tRNA-Pro  92.73 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  91.53 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0046  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372739  normal  0.328278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0030  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.640007  normal  0.447016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0034  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0097  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.96402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0001  tRNA-Pro  92.45 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.170167  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0059  tRNA-Pro  95.56 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0060  tRNA-Pro  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.16222e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0011  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0044  tRNA-Pro  88 
 
 
78 bp  69.9  8e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000299303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0013  tRNA-Pro  86.49 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.24358e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0012  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00369197  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>