25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1336 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  268  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  30.61 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  37.23 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  27.47 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3859  hypothetical protein  29.59 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1972  hypothetical protein  30.36 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.538462  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3358  hypothetical protein  29.7 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.887484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  22.83 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1244  hypothetical protein  22.45 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2562  hypothetical protein  29.03 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0903  hypothetical protein  28.71 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  24.21 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  26.36 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.436738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  24.14 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0759  hypothetical protein  28.72 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  25 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1087  hypothetical protein  27.96 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  24.47 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0131469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1171  hypothetical protein  27.27 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1389  hypothetical protein  27.96 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00337403  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0931  hypothetical protein  29.63 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  28.28 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  25.3 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  28.28 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0328  hypothetical protein  24.44 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.348534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>