More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0009 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007641  Rru_B0009  transposase  100 
 
 
308 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  100 
 
 
308 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  83.44 
 
 
399 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  83.44 
 
 
399 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  82.41 
 
 
399 aa  506  1e-142  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  82.41 
 
 
399 aa  506  1e-142  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  81.11 
 
 
399 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  80.46 
 
 
399 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  79.8 
 
 
399 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  80.13 
 
 
399 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  80.13 
 
 
399 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  79.8 
 
 
399 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  70.39 
 
 
398 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  66.99 
 
 
398 aa  417  1e-115  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  66.99 
 
 
398 aa  417  1e-115  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  66.99 
 
 
398 aa  417  1e-115  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  66.99 
 
 
398 aa  417  1e-115  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  66.99 
 
 
398 aa  417  1e-115  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  66.01 
 
 
403 aa  411  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  62.26 
 
 
402 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  62.26 
 
 
402 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  62.26 
 
 
402 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  62.26 
 
 
402 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  62.26 
 
 
402 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  62.26 
 
 
402 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  63.7 
 
 
402 aa  381  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  63.7 
 
 
402 aa  381  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  63.7 
 
 
402 aa  381  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  62.46 
 
 
402 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  62.14 
 
 
402 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  54.72 
 
 
406 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  54.72 
 
 
406 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  54.72 
 
 
406 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  54.72 
 
 
406 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  54.72 
 
 
406 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  54.72 
 
 
406 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  54.72 
 
 
406 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  54.72 
 
 
406 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  54.72 
 
 
406 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  56.12 
 
 
405 aa  336  3e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  56.12 
 
 
405 aa  336  3e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  56.12 
 
 
405 aa  336  3e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  56.12 
 
 
405 aa  336  3e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  56.12 
 
 
405 aa  336  3e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  56.12 
 
 
405 aa  336  3e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  56.12 
 
 
405 aa  336  3e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  53.04 
 
 
410 aa  305  8e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  53.04 
 
 
410 aa  305  8e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  53.04 
 
 
410 aa  305  8e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  53.04 
 
 
410 aa  305  8e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  51.94 
 
 
410 aa  305  9e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  51.94 
 
 
410 aa  305  9e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  51.94 
 
 
410 aa  305  9e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  52.08 
 
 
411 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  52.08 
 
 
411 aa  289  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  52.43 
 
 
411 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  52.43 
 
 
411 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10460  Transposase, Mutator family  50.68 
 
 
422 aa  286  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000746086  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10440  Transposase, Mutator family  50.68 
 
 
422 aa  286  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  5.72407e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  50.33 
 
 
409 aa  285  6e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  60.42 
 
 
384 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  46.44 
 
 
419 aa  261  7e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  46.1 
 
 
419 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  46.1 
 
 
419 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03400  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  9e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05430  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  46.6 
 
 
417 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16090  transposase  46.6 
 
 
390 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10260  transposase, mutator family  45.92 
 
 
417 aa  253  2e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  45.92 
 
 
415 aa  253  2e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  45.92 
 
 
415 aa  253  2e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  45.92 
 
 
415 aa  253  2e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  78.44 
 
 
266 aa  251  8e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2128  transposase, mutator type  77.42 
 
 
155 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.449064  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  44.56 
 
 
416 aa  248  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  44.56 
 
 
416 aa  248  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  44.56 
 
 
416 aa  248  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  45.52 
 
 
428 aa  248  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  44.71 
 
 
413 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>