More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3254 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3254  ABC transporter component  100 
 
 
258 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3217  cell division ATP-binding protein FtsE  62.78 
 
 
260 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11249  normal  0.222957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0701  ABC transporter related  63.94 
 
 
254 aa  268  8e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1595  cell division ATP-binding protein FtsE  61.57 
 
 
219 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2374  cell division ATP-binding protein FtsE  58.45 
 
 
285 aa  262  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.195215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2892  ABC transporter related  62.98 
 
 
237 aa  262  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.688447  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3572  cell division ATP-binding protein FtsE  59.17 
 
 
219 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  0.091896 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0100  cell division ATP-binding protein FtsE  58.8 
 
 
219 aa  261  7e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0984  cell division ATP-binding protein FtsE  57.59 
 
 
236 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3865  cell division ATP-binding protein FtsE  58.26 
 
 
219 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  59.17 
 
 
219 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3013  cell division ATP-binding protein FtsE  62.5 
 
 
235 aa  257  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563056  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1997  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  59.17 
 
 
219 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0022  cell division ATP-binding protein FtsE  55.32 
 
 
235 aa  253  2e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.640793  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2543  cell division ATP-binding protein FtsE  58.72 
 
 
227 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772851  normal  0.715925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0834  ABC transporter related  60.55 
 
 
219 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.389037  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0943  ABC transporter related  59.63 
 
 
219 aa  243  2e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1176  cell division ABC transpoter ATP-binding protein  59.63 
 
 
219 aa  242  4e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5218  cell division ATP-binding protein FtsE  59.17 
 
 
219 aa  241  8e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4027  cell division ATP-binding protein  57.77 
 
 
207 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2863  cell division ATP-binding protein FtsE  58.45 
 
 
253 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0362  cell division ATP-binding protein FtsE  60.73 
 
 
220 aa  234  1e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3091  cell division ATP-binding protein FtsE  59.63 
 
 
219 aa  234  1e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2983  cell division ATP-binding protein FtsE  58.18 
 
 
237 aa  233  2e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3089  cell division ATP-binding protein FtsE  58.45 
 
 
237 aa  233  2e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29144  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2195  cell division ATP-binding protein FtsE  62 
 
 
232 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204033  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1154  cell division ATP-binding protein FtsE  61.5 
 
 
231 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386083  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2518  cell division ATP-binding protein FtsE  59.36 
 
 
220 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3084  cell division ATP-binding protein FtsE  54.63 
 
 
223 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4867  ABC transporter related  60.55 
 
 
219 aa  225  5e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.459104  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0576  ABC transporter, ATPase subunit  60.55 
 
 
219 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0667  ABC transporter related  60.09 
 
 
219 aa  221  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0394716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2980  cell division ATP-binding protein FtsE  59.72 
 
 
230 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135492  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3498  ABC transporter related  52 
 
 
225 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.552315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3056  ABC transporter related  49.27 
 
 
223 aa  198  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03536  FtsE  44.2 
 
 
237 aa  197  1e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00279  ABC transporter ATPase subunit  43.48 
 
 
235 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3606  cell division ATP-binding protein FtsE  43.98 
 
 
227 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2373  cell division ATP-binding protein FtsE  46.33 
 
 
233 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.3444e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002139  cell division transporter ATP-binding protein FtsE  45.21 
 
 
224 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0306098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0578  cell division protein FtsE  47.17 
 
 
222 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00281853  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0240  cell division protein FtsE  47.17 
 
 
222 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.127861  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3978  cell division protein FtsE  47.17 
 
 
222 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  40.17 
 
 
228 aa  189  3e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0222  cell division protein FtsE  46.51 
 
 
223 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0345347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2989  cell division ATP-binding protein FtsE  45.05 
 
 
226 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.300559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3945  cell division ATP-binding protein FtsE  42.6 
 
 
224 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000529058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0100  cell division protein FtsE  46.23 
 
 
223 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0094  cell division protein FtsE  46.23 
 
 
223 aa  188  6e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3979  cell division ATP-binding protein FtsE  46.23 
 
 
230 aa  188  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000304408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48090  Cell-division ATP-binding protein FtsE  47.66 
 
 
222 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0159  cell division ATP-binding protein FtsE  43.36 
 
 
235 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5336  cell division ATP-binding protein FtsE  46.73 
 
 
223 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  44.65 
 
 
223 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2902  cell division ATP-binding protein FtsE  43.46 
 
 
222 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4174  cell division ATP-binding protein FtsE  47.66 
 
 
222 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00105133  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3762  cell division protein FtsE  46.08 
 
 
222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0733  cell division ATP-binding protein FtsE  51 
 
 
223 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3867  cell division protein FtsE  46.26 
 
 
221 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508824  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3772  cell division protein FtsE  46.08 
 
 
222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3941  cell division protein FtsE  46.08 
 
 
222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3839  cell division protein FtsE  46.08 
 
 
222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2017  ABC transporter related  49.25 
 
 
224 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3882  cell division protein FtsE  46.08 
 
 
222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.166736  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0732  cell division ATP-binding protein FtsE  43.98 
 
 
218 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2387  ABC transporter related  51 
 
 
223 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.41405  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04910  cell division ATP-binding protein FtsE  46.23 
 
 
223 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0953664  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2451  ABC transporter related  50.25 
 
 
223 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16471  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0291  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  39.62 
 
 
228 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.90691e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  41.89 
 
 
223 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.78962e-13 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0428  cell division ATP-binding protein FtsE  46.26 
 
 
223 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  42.92 
 
 
223 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4327  cell division ATP-binding protein FtsE  44.34 
 
 
223 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0296  putative cell division ATP-binding protein FtsE  39.62 
 
 
228 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  6.31483e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4750  ABC transporter  46.26 
 
 
223 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199681  normal  0.0424479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3467  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  43.11 
 
 
229 aa  185  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0471  cell division ATP-binding protein FtsE  46.5 
 
 
229 aa  185  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0252  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  45.79 
 
 
222 aa  184  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0253  cell division protein FtsE  45.79 
 
 
222 aa  184  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03265  hypothetical protein  45.79 
 
 
222 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3746  cell division protein FtsE  45.79 
 
 
222 aa  184  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3662  cell division protein FtsE  45.79 
 
 
222 aa  184  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3072  ABC transporter related  53.57 
 
 
229 aa  184  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134895  hitchhiker  0.0099373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4783  cell division protein FtsE  45.79 
 
 
222 aa  184  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3859  cell division protein FtsE  45.79 
 
 
222 aa  184  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3945  cell division protein FtsE  45.79 
 
 
222 aa  184  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03312  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  45.79 
 
 
222 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4064  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  44.81 
 
 
222 aa  184  1e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  42.79 
 
 
226 aa  184  1e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0220  cell division ATP-binding protein FtsE  45.28 
 
 
230 aa  184  1e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1676  ATP-binding component of a membrane-associated cell division complex FtsE  43.93 
 
 
247 aa  184  1e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0245  hypothetical protein  40.62 
 
 
227 aa  184  1e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3605  cell division ATP-binding protein FtsE  44.81 
 
 
233 aa  183  2e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000127054  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0469  cell division ATP-binding protein FtsE  45.75 
 
 
223 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2988  cell division ATP-binding protein FtsE  46.26 
 
 
222 aa  182  4e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0202  cell division ATP-binding protein FtsE  44.34 
 
 
231 aa  182  4e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000183823  decreased coverage  2.75574e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5160  cell division ATP-binding protein FtsE  45.79 
 
 
223 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1801  cell division ATP-binding protein FtsE  39.91 
 
 
239 aa  181  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.1053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0276  cell division ATP-binding protein FtsE  44.61 
 
 
229 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.04562e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0134  cell division ATP-binding protein FtsE  45.16 
 
 
220 aa  181  8e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>