More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0220 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0220  cell division ATP-binding protein FtsE  100 
 
 
230 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0202  cell division ATP-binding protein FtsE  92.89 
 
 
231 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000183823  decreased coverage  0.00000275574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3979  cell division ATP-binding protein FtsE  89.91 
 
 
230 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000304408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3605  cell division ATP-binding protein FtsE  89.73 
 
 
233 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000127054  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3467  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  89.14 
 
 
229 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0290  cell division ATP-binding protein FtsE  86.16 
 
 
238 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0172  cell division ATP-binding protein FtsE  85.71 
 
 
237 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000152449  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4585  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  85.97 
 
 
233 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4163  cell division ATP-binding protein FtsE  85.71 
 
 
237 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000108411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4294  cell division ATP-binding protein FtsE  85.71 
 
 
237 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000113777  normal  0.0247872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4093  cell division ATP-binding protein FtsE  85.71 
 
 
237 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3773  cell division ATP-binding protein FtsE  85.97 
 
 
233 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000852689  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3846  cell division ATP-binding protein FtsE  85.97 
 
 
233 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3971  cell division ATP-binding protein FtsE  85.97 
 
 
233 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00007474  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3504  ABC transporter related  85.52 
 
 
228 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316102  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0276  cell division ATP-binding protein FtsE  80.35 
 
 
229 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000204562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03536  FtsE  76.85 
 
 
237 aa  348  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3945  cell division ATP-binding protein FtsE  74.54 
 
 
224 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000529058  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0624  cell division ATP-binding protein FtsE  68.06 
 
 
222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0159  cell division ATP-binding protein FtsE  68.52 
 
 
235 aa  304  9.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4064  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  67.73 
 
 
222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0100  cell division protein FtsE  68.35 
 
 
223 aa  301  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0094  cell division protein FtsE  68.35 
 
 
223 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3867  cell division protein FtsE  68.35 
 
 
221 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508824  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0222  cell division protein FtsE  68.35 
 
 
223 aa  298  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0345347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3772  cell division protein FtsE  67.43 
 
 
222 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3839  cell division protein FtsE  67.43 
 
 
222 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3941  cell division protein FtsE  67.43 
 
 
222 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3762  cell division protein FtsE  67.43 
 
 
222 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3882  cell division protein FtsE  67.43 
 
 
222 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.166736  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03312  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  67.43 
 
 
222 aa  295  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3662  cell division protein FtsE  67.43 
 
 
222 aa  295  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03265  hypothetical protein  67.43 
 
 
222 aa  295  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0253  cell division protein FtsE  67.43 
 
 
222 aa  295  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0252  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  66.97 
 
 
222 aa  295  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3859  cell division protein FtsE  66.97 
 
 
222 aa  295  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4783  cell division protein FtsE  66.97 
 
 
222 aa  295  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3945  cell division protein FtsE  66.97 
 
 
222 aa  295  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3746  cell division protein FtsE  66.97 
 
 
222 aa  295  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3876  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  66.36 
 
 
223 aa  291  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0240  cell division protein FtsE  66.51 
 
 
222 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.127861  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3978  cell division protein FtsE  66.51 
 
 
222 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590462  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0578  cell division protein FtsE  66.51 
 
 
222 aa  290  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00281853  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00279  ABC transporter ATPase subunit  64.95 
 
 
235 aa  288  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2902  cell division ATP-binding protein FtsE  64.79 
 
 
222 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2373  cell division ATP-binding protein FtsE  64.49 
 
 
233 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000033444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002139  cell division transporter ATP-binding protein FtsE  64.49 
 
 
224 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0306098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2109  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  62.04 
 
 
217 aa  281  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0215  cell division ATP-binding protein  62.04 
 
 
217 aa  281  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.354221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4327  cell division ATP-binding protein FtsE  61.86 
 
 
223 aa  278  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3745  cell division ATP-binding protein FtsE  61.47 
 
 
224 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2988  cell division ATP-binding protein FtsE  61.82 
 
 
222 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3596  cell division ATP-binding protein FtsE  59.26 
 
 
230 aa  268  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0240123  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2723  hypothetical protein  61.97 
 
 
216 aa  261  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2596  hypothetical protein  61.97 
 
 
216 aa  261  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2989  cell division ATP-binding protein FtsE  59.82 
 
 
226 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.300559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4174  cell division ATP-binding protein FtsE  57.27 
 
 
222 aa  258  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00105133  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48090  Cell-division ATP-binding protein FtsE  56.82 
 
 
222 aa  258  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0355  cell division ATP-binding protein FtsE  56.36 
 
 
223 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5160  cell division ATP-binding protein FtsE  56.36 
 
 
223 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2660  cell division ATP-binding protein FtsE  57.41 
 
 
224 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8795  hitchhiker  0.0000942029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5336  cell division ATP-binding protein FtsE  56.82 
 
 
223 aa  254  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4983  cell division ATP-binding protein FtsE  56.36 
 
 
223 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5110  cell division ATP-binding protein FtsE  56.36 
 
 
225 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0134  cell division ATP-binding protein FtsE  57.75 
 
 
220 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4750  ABC transporter  55.91 
 
 
223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199681  normal  0.0424479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0428  cell division ATP-binding protein FtsE  55.91 
 
 
223 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04910  cell division ATP-binding protein FtsE  56.36 
 
 
223 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0953664  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1554  cell division ATP-binding protein FtsE  58.14 
 
 
216 aa  251  9.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.154084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0469  cell division ATP-binding protein FtsE  55.91 
 
 
223 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2739  ABC transporter related  53.46 
 
 
217 aa  239  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.569673  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2304  cell division ATP-binding protein FtsE  58.72 
 
 
226 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.820604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0375  cell division ATP-binding protein FtsE  56.28 
 
 
220 aa  234  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249019  decreased coverage  0.00264654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1545  cell division ATP-binding protein FtsE  52.73 
 
 
222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3615  ABC transporter related  54.63 
 
 
232 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0169  cell division ATP-binding protein FtsE  55.35 
 
 
223 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0732  cell division ATP-binding protein FtsE  53.52 
 
 
218 aa  228  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3673  cell division ATP-binding protein FtsE  51.85 
 
 
228 aa  223  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0471  cell division ATP-binding protein FtsE  53.02 
 
 
229 aa  221  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03715  cell division ATP-binding protein FtsE  50.46 
 
 
228 aa  221  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1035  cell division ATP-binding protein FtsE  53.46 
 
 
333 aa  220  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3717  cell division ATP-binding protein FtsE  49.54 
 
 
217 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.780877  normal  0.114133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3966  cell division ATP-binding protein FtsE  46.82 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000448693  unclonable  0.00000000011916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1860  cell division ATP-binding protein FtsE  46.09 
 
 
235 aa  215  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000300417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25190  cell division ATP-binding protein FtsE  51.61 
 
 
229 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.661516  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3073  cell division ATP-binding protein FtsE  49.55 
 
 
228 aa  214  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2155  cell division ATP-binding protein FtsE  50 
 
 
232 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2244  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0787455  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0864  cell division ATP-binding protein FtsE  50.69 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2752  cell division ATP-binding protein FtsE  53.49 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2372  cell division ATP-binding protein FtsE  53.49 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.125104  hitchhiker  0.000226971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1244  cell division ATP-binding protein FtsE  51.61 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2400  cell division ATP-binding protein FtsE  50.45 
 
 
262 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0253166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2769  cell division ATP-binding protein FtsE  49.35 
 
 
229 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0057  cell division ATP-binding protein FtsE  49.77 
 
 
213 aa  209  4e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2665  cell division ATP-binding protein FtsE  50 
 
 
273 aa  208  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0684834  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3781  cell division ATP-binding protein FtsE  48.42 
 
 
229 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  47.16 
 
 
227 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0284  cell division ATP-binding protein FtsE  48.46 
 
 
228 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.931477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1268  cell division ATP-binding protein FtsE  48.85 
 
 
229 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>