57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4550 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4550  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0102  hypothetical protein  78.26 
 
 		 115 aa  186  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  31.86 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  33.62 
 
 		 116 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  32.74 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1743  hypothetical protein  37.84 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  40.35 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  36.28 
 
 		 286 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  32.38 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  41.44 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  31.25 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  34.48 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  38.18 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  43.9 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  37.19 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4927  protein of unknown function DUF952  39.62 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  31.53 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  39.08 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  31.82 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  33.33 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.24 
 
 		 323 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  38.05 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  38.05 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  38.05 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  32.23 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  32.17 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  35.4 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  33.03 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  33.64 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  37.8 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  35.92 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  29.81 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  33.71 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  34.52 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  33.71 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  28.85 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  35.29 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  26.72 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  35.37 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.94 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  35.29 
 
 		 374 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  33.77 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2243  protein of unknown function DUF952  36.96 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0928716  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  30.39 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  31.03 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  39.6 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  28.43 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  30.34 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12470  hypothetical protein  30.97 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144496  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  28.04 
 
 		 131 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  32.69 
 
 		 120 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0372909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  34.48 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  30.67 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  29.73 
 
 		 115 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>