25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0275 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  191  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.270958  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  72.73 
 
 		 538 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  62.26 
 
 		 537 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  51.85 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  39.53 
 
 		 511 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  54.9 
 
 		 569 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  63.64 
 
 		 517 aa  50.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  50.94 
 
 		 532 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  44.71 
 
 		 570 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  49.06 
 
 		 520 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  50.94 
 
 		 849 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  46.3 
 
 		 518 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  51.92 
 
 		 529 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  38.27 
 
 		 525 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  38.27 
 
 		 525 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  52.94 
 
 		 544 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  49.06 
 
 		 540 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  39.51 
 
 		 501 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  39.51 
 
 		 501 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  45.28 
 
 		 519 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  45.28 
 
 		 528 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  48.08 
 
 		 529 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  46.15 
 
 		 539 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.23 
 
 		 503 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  43.4 
 
 		 517 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>