38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5338 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5338  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  296  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01775  lipoprotein  65.45 
 
 		 125 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00909333  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0049  putative lipoprotein  58.33 
 
 		 117 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00580  putative lipoprotein  57.5 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.342793  normal  0.195116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1251  hypothetical protein  56.14 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3205  hypothetical protein  53.85 
 
 		 164 aa  121  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0108  hypothetical protein  52.68 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3083  putative lipoprotein  52.68 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1652  putative lipoprotein  52.68 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3466  putative lipoprotein  52.68 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3969  putative lipoprotein  52.68 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3888  putative lipoprotein  52.68 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1456  lipoprotein  49.57 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1450  putative lipoprotein  52.08 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2722  putative lipoprotein  51.04 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1338  putative lipoprotein  51.04 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1389  putative lipoprotein  51.79 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4601  putative lipoprotein  44.83 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2913  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4222  putative lipoprotein  47.96 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.831557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4280  putative lipoprotein  45.69 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2760  hypothetical protein  45.24 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3428  hypothetical protein  45.38 
 
 		 125 aa  103  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2390  hypothetical protein  55.81 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3004  hypothetical protein  55.81 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3023  hypothetical protein  55.81 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2998  hypothetical protein  52.87 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.858311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4013  putative lipoprotein  45.92 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.567759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3561  putative lipoprotein  47.96 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0961019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5408  hypothetical protein  43.81 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0881  lipoprotein  41.12 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1130  integrase/recombinase  37.17 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4119  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4672  hypothetical protein  33.61 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22674  normal  0.0530626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1765  putative lipoprotein  32.35 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0225927  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05524  hypothetical protein  31.68 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1494  hypothetical protein  30.77 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3788  hypothetical protein  25.62 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0370713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>