11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2570 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2570  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  74.42 
 
 		 87 aa  137  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2694  hypothetical protein  34.12 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  35.29 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  25.3 
 
 		 360 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  30.88 
 
 		 329 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2794  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  38.78 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  35.29 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  32.86 
 
 		 363 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>