11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2374 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2374  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  324  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348169  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3352  hypothetical protein  82.61 
 
 		 166 aa  267  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3627  hypothetical protein  32.12 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0059  hypothetical protein  31.16 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1292  hypothetical protein  56.41 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2938  hypothetical protein  31.25 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418548  normal  0.0599766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3582  hypothetical protein  42.11 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  31.76 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3746  hypothetical protein  29.29 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0775427  normal  0.0498374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  27.78 
 
 		 159 aa  42  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>