53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0570 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0570  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000587846  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3263  hypothetical protein  54.32 
 
 		 322 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1132  hypothetical protein  51.23 
 
 		 322 aa  318  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.123306  normal  0.479537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1985  hypothetical protein  53.99 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.811604  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2665  protein of unknown function DUF897  49.85 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1405  protein of unknown function DUF897  47.55 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3694  protein of unknown function DUF897  46.55 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1292  protein of unknown function DUF897  47.06 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.209993  normal  0.286944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0485  hypothetical protein  37.68 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3830  hypothetical protein  43.48 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0109  hypothetical protein  43.75 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2163  hypothetical protein  38.77 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1969  hypothetical protein  41.39 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000472474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2950  hypothetical protein  37.3 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02901  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  38.75 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4477  hypothetical protein  42.68 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1580  permease  38.12 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2730  permease  38.18 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07971  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  38.77 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02331  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  37.8 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1247  hypothetical protein  41.37 
 
 		 310 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.252971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0845  protein of unknown function DUF897  38.02 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106214  normal  0.641047 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02331  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  36.65 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.736021  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02311  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  36.34 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0215  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  36.02 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0139  hypothetical protein  38.58 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618095  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4061  hypothetical protein  40.81 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0773794  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02421  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  35.58 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.163448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1619  protein of unknown function DUF897  35.8 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3237  protein of unknown function DUF897  41.95 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2056  hypothetical protein  36.96 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0635  protein of unknown function DUF897  37.62 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1267  hypothetical protein  37.54 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.399434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2255  hypothetical protein  34.76 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.301479  normal  0.773534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3084  hypothetical protein  35.92 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0692  hypothetical protein  35.64 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3259  hypothetical protein  35.29 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0929  hypothetical protein  34.19 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3758  hypothetical protein  35.39 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0919  protein of unknown function DUF897  33.87 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0865  hypothetical protein  34.74 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3443  hypothetical protein  33.87 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3107  hypothetical protein  34.2 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0834  hypothetical protein  33.88 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0703  hypothetical protein  35.39 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.463597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0895  hypothetical protein  33.55 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1475  sodium-dependent bicarbonate transporter  29.18 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.713474  normal  0.327214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1249  protein of unknown function DUF897  28.93 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1280  protein of unknown function DUF897  28.93 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0821415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1268  protein of unknown function DUF897  28.29 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5063  protein of unknown function DUF897  25.82 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3027  hypothetical protein  26.87 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12412  hypothetical protein  35.88 
 
 		 417 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.628443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>