72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3580 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 104 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  98.08 
 
 		 104 aa  199  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  56.52 
 
 		 148 aa  106  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  52.75 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  46.39 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  62.2 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  51.69 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  53.93 
 
 		 97 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  51.76 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 99 aa  89.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  48.96 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  48.96 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  48.96 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  48.45 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  61.29 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  46.59 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4012  gas vesicle protein GVPa  62.71 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  50.98 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  57.14 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  41.54 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  49.06 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.58 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  58.49 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  47.54 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.18 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.18 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.18 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  64.29 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  42.86 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  39.13 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  57.78 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  44 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  55.56 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  38.71 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  47.62 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.9 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.9 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  52.94 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  53.33 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.9 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.9 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  40.3 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  35.14 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  42.11 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  35.14 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  38.03 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  38.03 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  49.06 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  38.03 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.23 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.23 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  41.18 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.23 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.23 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.23 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.23 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  37.88 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  36.84 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.23 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  37.7 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  48.08 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  58.97 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  54.55 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  48.08 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  42.59 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  37.21 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  32.84 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  36.17 
 
 		 85 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>