27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00830 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00830  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  386  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.584767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02076  putative signal peptide protein  37.42 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4852  hypothetical protein  35.4 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4744  hypothetical protein  34.78 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.6988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215889  normal  0.294767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3277  hypothetical protein  31.06 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.0376988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0130  hypothetical protein  34.78 
 
 		 175 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4475  conserved hypothetical signal peptide protein  34.86 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5528  hypothetical protein  35.48 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5333  hypothetical protein  35.48 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4952  putative signal peptide protein  30.54 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4280  hypothetical protein  30.19 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1240  hypothetical protein  32.79 
 
 		 247 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000298594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0364  hypothetical protein  32.79 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000215357  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1549  hypothetical protein  32.79 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1737  hypothetical protein  32.79 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000645474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3004  hypothetical protein  32.79 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000190621  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2888  hypothetical protein  32.79 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000473114  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0399  hypothetical protein  32.79 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000314209  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5399  hypothetical protein  34.78 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921981  normal  0.427129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0787  putative signal peptide protein  37.23 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4226  putative signal peptide protein  33.73 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4114  conserved hypothetical signal peptide protein  33.73 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.623928  normal  0.213496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2208  hypothetical protein  32.79 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0139  transport-associated  31.2 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2224  transport-associated  27.56 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4119  hypothetical protein  27.07 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>