113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3000 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 114 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242701  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.33 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1465  acetyltransferase  28.46 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  42.03 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4956  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 247 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4620  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.73 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.37 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1263  acetyltransferase  27.69 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0337947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1236  acetyltransferase  27.69 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1366  acetyltransferase  27.69 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000207819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.68 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2337  GCN5-related N-acetyltransferase  40.58 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1505  acetyltransferase, GNAT family  35.38 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2715  acetyltransferase, GNAT family  40.58 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1437  acetyltransferase, GNAT family  27.69 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69581e-17 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.62 
 
 		 860 aa  46.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 		 173 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1382  GCN5-related N-acetyltransferase  41.27 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1790  GCN5-related N-acetyltransferase  41.27 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4329  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.086344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2158  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38.33 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0157524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.68 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  43.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  43.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.68 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  43.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  43.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  43.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  43.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  43.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1401  acetyltransferase, GNAT family  25.58 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000159569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.48 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.7 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000312677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4290  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 		 190 aa  43.5  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.67 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.67 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0628  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.07 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1048  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.68 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.070791  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.07 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.5 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2427  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3461  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.88 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  42.03 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0044  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2256  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.33 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5096  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.66 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  41.18 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0866  acetyltransferase  33.33 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3837  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000098197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0738  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1923  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0630  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.86 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 		 172 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38.98 
 
 		 150 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0380  acetyltransferase  39.66 
 
 		 191 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.335252  hitchhiker  0.000000351254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3283  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.88 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.33549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3325  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.88 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 		 192 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00359187  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 		 132 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  44.26 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5098  acetyltransferase, GNAT family  38.18 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1084  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.88 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0126129  hitchhiker  0.000306087 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4707  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 203 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0617246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0302  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.7 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275803  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1231  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.937528  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3157  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000750548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6006  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.07 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.132582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  45.61 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02240  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 		 781 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  37.7 
 
 		 891 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61880  peptide n-acetyltransferase RimI  36.67 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355527  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.5 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1385  hypothetical protein  37.65 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5385  peptide n-acetyltransferase RimI  36.67 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1406  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2855  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.1 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10390  acetyltransferase  36.9 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1918  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0771647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>