15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0739 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0739  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0008  hypothetical protein  86.96 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0011  hypothetical protein  78.46 
 
 		 69 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2219  hypothetical protein  55.56 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2991  hypothetical protein  59.18 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.310456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3220  hypothetical protein  54.39 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1035  hypothetical protein  54.39 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1615  hypothetical protein  56.36 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1089  hypothetical protein  53.06 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3019  hypothetical protein  54.72 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189985  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0173  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5112  hypothetical protein  49.06 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3278  hypothetical protein  47.54 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2421  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4508  hypothetical protein  45.45 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>