More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1398 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1398  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
179 aa  360  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.453151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  82.76 
 
 
186 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  76.97 
 
 
190 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  79.89 
 
 
191 aa  276  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  73.6 
 
 
187 aa  256  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  70.22 
 
 
190 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  66.67 
 
 
188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  66.1 
 
 
188 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  66.1 
 
 
188 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5031  Maltose O-acetyltransferase  66.28 
 
 
183 aa  230  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  65.54 
 
 
186 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  63.84 
 
 
188 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4911  maltose O-acetyltransferase  66.86 
 
 
183 aa  225  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  65.7 
 
 
183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  67.05 
 
 
187 aa  220  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0123  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  65.14 
 
 
178 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  65.12 
 
 
194 aa  216  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.71 
 
 
187 aa  188  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0939  maltose O-acetyltransferase  52.57 
 
 
183 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  55.43 
 
 
187 aa  181  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  55.43 
 
 
187 aa  181  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  50.29 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  49.71 
 
 
197 aa  171  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1874  maltose O-acetyltransferase  50 
 
 
187 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3377  maltose O-acetyltransferase  50 
 
 
187 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000821648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  53.41 
 
 
192 aa  167  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1750  hexapaptide repeat-containing transferase  51.41 
 
 
182 aa  167  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410351  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3140  maltose O-acetyltransferase  50.57 
 
 
187 aa  167  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0964249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3375  maltose O-acetyltransferase  50.57 
 
 
187 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.567242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3050  maltose O-acetyltransferase  50 
 
 
187 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000408787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3377  maltose O-acetyltransferase  50.57 
 
 
187 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3155  maltose O-acetyltransferase  50.57 
 
 
187 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3402  maltose O-acetyltransferase  50.57 
 
 
187 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00827475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4442  maltose O-acetyltransferase  49.71 
 
 
185 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.260239 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2179  transferase hexapeptide repeat containing protein  50.86 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.167318  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0703  Maltose O-acetyltransferase  51.43 
 
 
185 aa  165  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998989  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0502  maltose O-acetyltransferase  48.57 
 
 
183 aa  164  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00410  maltose O-acetyltransferase  48 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3151  transferase hexapeptide repeat containing protein  48 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00415  hypothetical protein  48 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3157  maltose O-acetyltransferase  48 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0535  maltose O-acetyltransferase  48 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0494  maltose O-acetyltransferase  48 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3080  hexapaptide repeat-containing transferase  48.86 
 
 
187 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00258923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3668  hexapaptide repeat-containing transferase  47.43 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0532  maltose O-acetyltransferase  47.43 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0502164  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1260  maltose O-acetyltransferase  48.57 
 
 
184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0391  maltose O-acetyltransferase  47.43 
 
 
183 aa  160  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0549  maltose O-acetyltransferase  47.43 
 
 
183 aa  161  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299767  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0513  maltose O-acetyltransferase  46.86 
 
 
183 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000528215  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0665  maltose O-acetyltransferase  50.29 
 
 
206 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  47.43 
 
 
191 aa  157  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0575  maltose O-acetyltransferase  46.29 
 
 
183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00855967  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0522  maltose O-acetyltransferase  46.29 
 
 
183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00115683  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0516  maltose O-acetyltransferase  46.29 
 
 
183 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000205896  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3135  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.98 
 
 
182 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1396  maltose O-acetyltransferase  46.86 
 
 
187 aa  154  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000138737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  45.14 
 
 
185 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  44 
 
 
186 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0465  maltose O-acetyltransferase  43.43 
 
 
186 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0760174  hitchhiker  0.0000000000353002 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0384  Maltose O-acetyltransferase  46.59 
 
 
213 aa  148  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00312808  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1584  hexapaptide repeat-containing transferase  46.89 
 
 
196 aa  147  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3469  galactoside-O-acetyltransferase  41.28 
 
 
202 aa  147  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303917  decreased coverage  0.000594115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3034  putative sugar acetyltransferase  46.02 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  50.57 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02281  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) protein  42.86 
 
 
190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1146  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.71 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0483  maltose O-acetyltransferase  43.02 
 
 
189 aa  145  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.833227  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2590  maltose transacetylase  41.53 
 
 
195 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2912  maltose transacetylase  41.53 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.231486  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1011  acetyltransferase  42.29 
 
 
182 aa  144  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0285362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0314  galactoside O-acetyltransferase  44.75 
 
 
197 aa  141  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.169128  hitchhiker  0.000159689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  48.57 
 
 
182 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3747  nodulation protein L  41.71 
 
 
184 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103184  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2162  maltose O-acetyltransferase  46.86 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.225842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4253  Galactoside O-acetyltransferase  47.22 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00506408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3624  nodulation protein L  42.29 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03419  O-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11510)  43.65 
 
 
233 aa  139  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3556  nodulation protein L  41.14 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00247017  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00930  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  44 
 
 
192 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 
193 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2515  hexapaptide repeat-containing transferase  45.83 
 
 
176 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323366  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0686  nodulation protein L  41.14 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00118691  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  51.8 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1850  maltose O-acetyltransferase  39.43 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2484  hexapaptide repeat-containing transferase  45.14 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.754666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3168  hexapaptide repeat-containing transferase  41.14 
 
 
203 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  53.28 
 
 
181 aa  134  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7863  galactoside O-acetyltransferase  45.45 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28841  predicted protein  40.23 
 
 
204 aa  130  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1896  acetyltransferase  42.39 
 
 
225 aa  130  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2617  hexapaptide repeat-containing transferase  42.61 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2730  hexapaptide repeat-containing transferase  42.61 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1730  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.61 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2294  hexapaptide repeat-containing transferase  44 
 
 
187 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0503645  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2366  maltose O-acetyltransferase  44 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00399682  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2655  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.61 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1959  Maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.963702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4251  transferase hexapeptide repeat containing protein  52 
 
 
182 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0399  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  38.86 
 
 
192 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.345276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>