15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1035 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1035  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3220  hypothetical protein  82.26 
 
 		 63 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1615  hypothetical protein  79.03 
 
 		 63 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2421  hypothetical protein  69.64 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0008  hypothetical protein  55.74 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0173  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0011  hypothetical protein  60.71 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894998  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0739  hypothetical protein  54.39 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2219  hypothetical protein  55.56 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3278  hypothetical protein  60.98 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1089  hypothetical protein  50.94 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1708  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.118644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2991  hypothetical protein  50.98 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.310456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3019  hypothetical protein  42.37 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189985  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5112  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>