17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2258 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2258  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  100 
 
 		 211 aa  443  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000630044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2262  hypothetical protein  69.23 
 
 		 239 aa  297  7e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.051771  hitchhiker  0.00807275 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1966  hypothetical protein  67.79 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.73839  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.57 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  30.41 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1611  hypothetical protein  24.22 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  24.83 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  24.83 
 
 		 160 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  24.83 
 
 		 160 aa  48.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  21.88 
 
 		 167 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  25.93 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  27.61 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  25 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  22.36 
 
 		 157 aa  45.1  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  24.42 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  22 
 
 		 447 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  26.13 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>