15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0030 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.304564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0238  hypothetical protein  48.87 
 
 		 312 aa  309  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4242  hypothetical protein  59.9 
 
 		 201 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0886  hypothetical protein  43.46 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2191  hypothetical protein  41.42 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.25203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2290  hypothetical protein  41.1 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4243  hypothetical protein  71.43 
 
 		 105 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025011 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1623  hypothetical protein  33.72 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0511  hypothetical protein  40 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.457472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0005  conserved hypothetical protein (DUF511 domain protein)  36.13 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1774  HrgA protein  33.78 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.508173  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1717  hypothetical protein  32.72 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  30.63 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1748  HrgA protein  32.21 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2021  hypothetical protein  48.57 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>