179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5266 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  94.63 
 
 		 149 aa  293  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  93.96 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5031  hypothetical protein  85.33 
 
 		 150 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  79.87 
 
 		 149 aa  258  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  77.18 
 
 		 149 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  76.51 
 
 		 149 aa  247  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  71.14 
 
 		 149 aa  221  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  71.43 
 
 		 152 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  71.43 
 
 		 152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47380  hypothetical protein  63.49 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  54.11 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0781  protein of unknown function DUF55  53.64 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0209669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02383  hypothetical protein  54.36 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  51.37 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  51.37 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  50.34 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  53.33 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  49.01 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  49.01 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  51.66 
 
 		 153 aa  156  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  50.99 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  50.99 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  50.99 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  51.66 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0651  hypothetical protein  50.68 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  50.33 
 
 		 153 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  50.33 
 
 		 153 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  48 
 
 		 157 aa  153  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  50.33 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2792  hypothetical protein  51.03 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.495937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  52.32 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0831  hypothetical protein  51.01 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0961  hypothetical protein  51.01 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23359  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2670  protein of unknown function DUF55  50.68 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01784  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.280348  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0843  hypothetical protein  51.01 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2403  hypothetical protein  52.05 
 
 		 168 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  49.01 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  48.3 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2212  protein of unknown function DUF55  50 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0992  protein of unknown function DUF55  50.34 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1184  hypothetical protein  50.34 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4320  protein of unknown function DUF55  51.43 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000124301  hitchhiker  0.00573912 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2330  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0213902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2956  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1032  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1642  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4260  protein of unknown function DUF55  51.43 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5789  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1025  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000631398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  45.45 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2217  hypothetical protein  48.99 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2375  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2463  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.563467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3282  protein of unknown function DUF55  49.67 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0784521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1847  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2507  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2458  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2669  hypothetical protein  51.01 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0836  hypothetical protein  48.32 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4432  hypothetical protein  50.36 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.830647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2674  hypothetical protein  49.66 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4934  protein of unknown function DUF55  52.74 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  50.33 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  49.68 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  48.65 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  44.81 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  51.06 
 
 		 189 aa  143  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1663  protein of unknown function DUF55  51.01 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4026  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0614  hypothetical protein  45.7 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.78998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  47.44 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2092  hypothetical protein  51.02 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05161  hypothetical protein  45.19 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2135  protein of unknown function DUF55  52.55 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  47.02 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16301  hypothetical protein  45.99 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  48.32 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  47.65 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2927  hypothetical protein  50.33 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2948  hypothetical protein  45.33 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3972  hypothetical protein  48.34 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.766671  normal  0.0536087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  48.03 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3514  hypothetical protein  48.34 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16181  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16061  hypothetical protein  48.89 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1521  hypothetical protein  45.26 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0365947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0190  protein of unknown function DUF55  46.85 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.450545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  48.32 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18281  hypothetical protein  43.57 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  46.36 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2834  hypothetical protein  48.3 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  46.71 
 
 		 165 aa  133  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0960  hypothetical protein  43.57 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  46.98 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  47.02 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  46.62 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0523  hypothetical protein  42.34 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>