21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0588 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.87 
 
 		 981 bp  1205    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0588    100 
 
 		 944 bp  1871    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000476489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.1 
 
 		 1014 bp  270  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.878977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.77 
 
 		 975 bp  119  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26933  normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1235  NAD-dependent epimerase/dehydratase  85.19 
 
 		 963 bp  87.7  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0651  GDP-L-fucose synthetase  78.8 
 
 		 972 bp  85.7  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.193687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  85.87 
 
 		 966 bp  79.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.757489 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1864  GDP-L-fucose synthetase  87.18 
 
 		 960 bp  75.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2730  GDP-L-fucose synthetase  90.57 
 
 		 981 bp  65.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  85.71 
 
 		 978 bp  65.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.33 
 
 		 942 bp  63.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000746713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  83.33 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.33 
 
 		 945 bp  60  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  83.72 
 
 		 951 bp  60  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02915  GDP-fucose synthetase  88.68 
 
 		 1089 bp  58  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0734964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2900  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  84.21 
 
 		 936 bp  56  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2384  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.5 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2695  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.22 
 
 		 966 bp  52  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0303782 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1775  GDP-L-fucose synthetase  82.56 
 
 		 984 bp  52  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2967  GDP-L-fucose synthetase  82.72 
 
 		 966 bp  50.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.75 
 
 		 975 bp  48.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>