19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4685 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4685  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0057537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0792  hypothetical protein  49.72 
 
 		 167 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2832  hypothetical protein  48.55 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0989794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1826  hypothetical protein  41.76 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00184  hypothetical protein  40.35 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0355  hypothetical protein  35.29 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00773  hypothetical protein  33.9 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0101845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1321  hypothetical protein  33.52 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193579  normal  0.134075 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2126  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.742072  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2216  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  34.51 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  30.22 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  34.34 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  38.46 
 
 		 251 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  34.62 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  57.14 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.33 
 
 		 210 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>