105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1740 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1740  putative transposase  100 
 
 		 161 aa  327  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.704353 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  38.16 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  38.16 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000100064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  36.55 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000338924  decreased coverage  0.0000208115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  31.21 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  29.19 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  29.19 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  30.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  30.25 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  28.93 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01717  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02044  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02797  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02881  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04733  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04944  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05295  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05475  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05743  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05754  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06030  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06490  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06979  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07081  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  37.06 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  37.06 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2336  transposase IS3/IS911 family protein  34.73 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3393  transposase IS3/IS911 family protein  39.01 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3415  transposase IS3/IS911 family protein  37.41 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  29.41 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1534  transposase IS3/IS911 family protein  30.2 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.200633  normal  0.785426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0129  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0729  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0817  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1253  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1941  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3142  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.457423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4351  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  34.62 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  35.57 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  35.14 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0301  transposase IS3/IS911 family protein  28.43 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.601541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4152  transposition helper protein  35.29 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2220  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0646  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000318322  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1099  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00548564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1699  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000451085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0650  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.124888  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  32.08 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2336  hypothetical protein  32.5 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2149  putative transposase  29.86 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01832  transposase IS3/IS911 family protein  30.06 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01834  transposase IS3/IS911 family protein  30.06 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02258  transposase IS3/IS911 family protein  30.06 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02619  transposase IS3/IS911 family protein  30.06 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2067  hypothetical protein  32.5 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2169  hypothetical protein  32.5 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3103  transposase IS3/IS911 family protein  25 
 
 		 116 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2330  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1476  hypothetical protein  32.5 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0317  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1239  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2203  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0499137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3026  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3317  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3927  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4344  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>