More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0330 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0330  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  241  2e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  1.52451e-08  hitchhiker  0.00105962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0485  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  241  2e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.17206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0611  50S ribosomal protein L14  95.9 
 
 
122 aa  235  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00801409  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0391  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  234  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0304428  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2315  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  234  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156512  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0383  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  234  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  3.37556e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5060  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  233  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  231  2e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  9.45972e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3432  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  231  2e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0231126  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3939  50S ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  228  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1032  ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  228  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389871  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  3.3095e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  9.01692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  221  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  1.57529e-09  decreased coverage  5.79661e-07 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  7.08463e-06  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  2.65489e-05  decreased coverage  1.45163e-12 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.83624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  221  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  1.58675e-06  hitchhiker  3.86502e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  221  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  86.07 
 
 
162 aa  222  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  220  5e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.1877e-07  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  220  5e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  2.5532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  220  5e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.45042e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 
122 aa  219  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.11281e-09  hitchhiker  1.95891e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  219  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  219  1e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  4.45572e-08 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0063  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  218  2e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  8.10078e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0060  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  218  2e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  1.71332e-14  hitchhiker  1.54022e-17 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  218  2e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.438e-07  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  218  2e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  6.32835e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  217  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  8.52888e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  217  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.75128e-05  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  217  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.57249e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  217  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  9.89644e-10  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  217  4e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  9.64027e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0777  ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  216  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.94728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  209  8e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  208  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.13124e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  206  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  206  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  1.72755e-14  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  2.7231e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  3.79152e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  3.05715e-05  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  204  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  204  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  204  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04511  50S ribosomal protein L14  83.05 
 
 
119 aa  203  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00805091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  79.51 
 
 
122 aa  201  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  201  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  200  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  2.90326e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  200  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  199  1e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.61836e-05  hitchhiker  1.00945e-06 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  199  1e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  198  2e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  9.71398e-07  hitchhiker  9.93182e-08 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  198  2e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.98489e-08  unclonable  3.02699e-12 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  195  1e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  6.86211e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0194  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  195  2e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.68914e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0431  50S ribosomal protein L14P  78.05 
 
 
123 aa  195  2e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0205903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0168  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  195  2e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.80121e-09  hitchhiker  0.000304102 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1844  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  194  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0430762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0848  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  194  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0180  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.57275e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4680  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.05676e-08  unclonable  1.17044e-08 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0347  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  194  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.08749e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2314  ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  194  4e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  2.8271e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0223  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  194  4e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.01155e-09  unclonable  7.31174e-06 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0338  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
160 aa  193  7e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.47925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4307  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  193  8e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.41408e-08  unclonable  4.97407e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.83704e-08  hitchhiker  1.3297e-09 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0070  50S ribosomal protein L14  74.8 
 
 
123 aa  192  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.46326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0158  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  192  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.51869e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3749  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.23635e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4160  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.82968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0204  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.38487e-07  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4046  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.76442e-07  unclonable  3.58198e-12 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0241  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0209  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.78183e-08  unclonable  1.39083e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0210  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.95848e-09  unclonable  8.19027e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0206  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.5278e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06350  50S ribosomal protein L14  79.13 
 
 
116 aa  191  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0415  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
123 aa  191  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0110237  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0333  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
123 aa  191  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  9.2381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  75.61 
 
 
123 aa  190  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.01498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  75.61 
 
 
123 aa  190  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.64384e-09  normal  0.0248646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  75.61 
 
 
123 aa  190  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.2346e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  75.61 
 
 
123 aa  190  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  1.32736e-07  hitchhiker  7.17726e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>