More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3997 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0417  anthranilate synthase component I  84.38 
 
 		 493 aa  846    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  64.23 
 
 		 495 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0753  anthranilate synthase component I  83.27 
 
 		 492 aa  822    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.196571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0568  anthranilate synthase, component I  83.91 
 
 		 493 aa  839    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0451  anthranilate synthase component I  84.38 
 
 		 493 aa  845    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.365985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4609  anthranilate synthase component I  84.73 
 
 		 493 aa  844    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2494  anthranilate synthase component I  65.16 
 
 		 492 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.184686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5118  anthranilate synthase component I  85.51 
 
 		 492 aa  835    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46640  anthranilate synthase component I  85.69 
 
 		 492 aa  855    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3997  anthranilate synthase component I  100 
 
 		 496 aa  1013    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346347  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2323  anthranilate synthase, component I  64.01 
 
 		 518 aa  643    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.933209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4785  anthranilate synthase component I  84.25 
 
 		 493 aa  843    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.531444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07940  anthranilate synthase component I  83.67 
 
 		 492 aa  824    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0448  anthranilate synthase component I  84.18 
 
 		 493 aa  845    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.422801  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3517  anthranilate synthase component I  65.03 
 
 		 495 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2109  anthranilate synthase component I  64.3 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  63.33 
 
 		 502 aa  628  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  64.42 
 
 		 489 aa  626  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2082  anthranilate synthase component I  63.49 
 
 		 491 aa  623  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  64.61 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0747  anthranilate synthase, component I  62.35 
 
 		 493 aa  616  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2362  anthranilate synthase component I  62.83 
 
 		 495 aa  614  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  64.61 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2228  anthranilate synthase, component I  60.76 
 
 		 521 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3481  anthranilate synthase component I  60.74 
 
 		 491 aa  598  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2471  anthranilate synthase, component I  59.92 
 
 		 494 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0266  anthranilate synthase component I  60.74 
 
 		 501 aa  590  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  60.37 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  59.3 
 
 		 491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0463  anthranilate synthase component I  59.15 
 
 		 497 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612638  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0439  anthranilate synthase component I  59.15 
 
 		 497 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.629503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0506  anthranilate synthase component I  58.55 
 
 		 497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2698  anthranilate synthase component I  58.15 
 
 		 497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  59.55 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2571  anthranilate synthase component I  58.55 
 
 		 497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0534  anthranilate synthase component I  58.55 
 
 		 497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2860  anthranilate synthase component I  58.35 
 
 		 497 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3023  anthranilate synthase component I  57.23 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3621  anthranilate synthase component I  58.15 
 
 		 497 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2909  anthranilate synthase component I  57.95 
 
 		 522 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0926  anthranilate synthase component I  57.43 
 
 		 490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3463  anthranilate synthase component I  57.49 
 
 		 491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3178  anthranilate synthase component I  57.09 
 
 		 508 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2881  anthranilate synthase component I  56.39 
 
 		 509 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0533  anthranilate synthase component I  57.34 
 
 		 497 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1910  anthranilate synthase component I  57.34 
 
 		 522 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3575  anthranilate synthase component I  57.34 
 
 		 522 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889198  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0157  anthranilate synthase component I  58.73 
 
 		 501 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3556  anthranilate synthase component I  57.34 
 
 		 522 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3583  anthranilate synthase component I  57.34 
 
 		 522 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0940  anthranilate synthase component I  57.34 
 
 		 522 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0644  anthranilate synthase component I  57.34 
 
 		 522 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3496  anthranilate synthase component I  58.55 
 
 		 497 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.703327  hitchhiker  0.000325099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0461  anthranilate synthase component I  58.95 
 
 		 497 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0179  anthranilate synthase component I  57.91 
 
 		 501 aa  555  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2758  anthranilate synthase component I  56.08 
 
 		 510 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.654997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0148  anthranilate synthase component I  56.71 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0356  anthranilate synthase component I  55.95 
 
 		 499 aa  552  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0366  anthranilate synthase component I  55.95 
 
 		 519 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1212  anthranilate synthase component I  56.18 
 
 		 517 aa  551  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.18446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3897  anthranilate synthase component I  56.71 
 
 		 495 aa  548  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.839724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3123  anthranilate synthase component I  55.49 
 
 		 510 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.274281  normal  0.443979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0442  anthranilate synthase component I  55.09 
 
 		 499 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0752  anthranilate synthase component I  54.78 
 
 		 499 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0162  anthranilate synthase component I  56.11 
 
 		 501 aa  541  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.487235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3654  anthranilate synthase component I  55.18 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0573  anthranilate synthase component I  55.97 
 
 		 500 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3607  anthranilate synthase component I  55.94 
 
 		 503 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4457  anthranilate synthase component I  51.52 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  53.75 
 
 		 496 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  50.1 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  50.1 
 
 		 491 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  51.33 
 
 		 491 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  48.57 
 
 		 491 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  49.9 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  50.61 
 
 		 491 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  46.63 
 
 		 485 aa  458  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1271  anthranilate synthase, component I  46.63 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  49.29 
 
 		 491 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  49.9 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  47.23 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3579  anthranilate synthase component I  50.69 
 
 		 574 aa  438  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736027  normal  0.0487715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  45.95 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  47.74 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  45.73 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4721  anthranilate synthase, component I  46.57 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  47.53 
 
 		 539 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2132  anthranilate synthase component I  51.24 
 
 		 500 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1891  anthranilate synthase component I  48.45 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00894891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  48.03 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4378  anthranilate synthase component I  48.98 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3792  anthranilate synthase, component I  47.32 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3594  anthranilate synthase component I  45.07 
 
 		 503 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0156  anthranilate synthase component I  47.9 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.970752  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1796  anthranilate synthase component I  49.04 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00033121  normal  0.176001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  45.1 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1234  anthranilate synthase component I  49.9 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0111358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  47.18 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4552  anthranilate synthase component I  44.84 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1776  anthranilate synthase  45.66 
 
 		 530 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>