33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0079 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0079  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  313  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6279  hypothetical protein  53.55 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72360  hypothetical protein  53.55 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5091  inhibitor of vertebrate lysozyme  55.19 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0152765  normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0136  inhibitor of vertebrate lysozyme  53.25 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0154  inhibitor of vertebrate lysozyme  51.95 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0152  inhibitor of vertebrate lysozyme  54.23 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0260  hypothetical protein  51.97 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0330  hypothetical protein  50.66 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0043  hypothetical protein  48.57 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3576  inhibitor of vertebrate lysozyme  32.03 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1206  hypothetical protein  37.07 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0470607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1323  inhibitor of vertebrate lysozyme  37.07 
 
 		 169 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3093  hypothetical protein  37.07 
 
 		 169 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00138636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1276  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0982  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1120  hypothetical protein  30.77 
 
 		 282 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1544  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1127  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3047  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13420  hypothetical protein  34.17 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.870374  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3024  hypothetical protein  32.32 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1125  Inhibitor of vertebrate lysozyme  30.56 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.342646 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00219  hypothetical protein  25.2 
 
 		 157 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0264  C-lysozyme inhibitor  25.2 
 
 		 149 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.998632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0216  C-lysozyme inhibitor  25.2 
 
 		 157 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00215  inhibitor of vertebrate C-lysozyme  25.2 
 
 		 157 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0232  C-lysozyme inhibitor  25.2 
 
 		 149 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0959061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3400  C-lysozyme inhibitor  25.2 
 
 		 157 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0252  C-lysozyme inhibitor  25.2 
 
 		 157 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0248  C-lysozyme inhibitor  25.2 
 
 		 157 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3387  Inhibitor of vertebrate lysozyme  25.2 
 
 		 148 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>