58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5017 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_5017  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.998448  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0497  hypothetical protein  62.37 
 
 
199 aa  261  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3529  hypothetical protein  61.34 
 
 
199 aa  261  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0433  hypothetical protein  62.37 
 
 
238 aa  260  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2641  hypothetical protein  56.41 
 
 
200 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.868545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2978  nitroreductase  57.73 
 
 
199 aa  241  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30800  hypothetical protein  53.85 
 
 
200 aa  235  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0987437  hitchhiker  0.000000000186465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2455  nitroreductase  58.25 
 
 
199 aa  226  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2105  hypothetical protein  58.25 
 
 
212 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1487  nitroreductase  58.25 
 
 
199 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3410  hypothetical protein  44.74 
 
 
199 aa  198  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3172  nitroreductase family protein  44.74 
 
 
199 aa  198  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000372111  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1909  nitroreductase family protein  48.26 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3400  hypothetical protein  45.26 
 
 
199 aa  198  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3421  hypothetical protein  44.74 
 
 
199 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1116  nitroreductase family protein  48.97 
 
 
201 aa  198  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169021  normal  0.724836 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3099  nitroreductase family protein  44.74 
 
 
199 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1545  hypothetical protein  47.64 
 
 
202 aa  197  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.090911  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0369  nitroreductase family protein  45.56 
 
 
199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00179  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1777  hypothetical protein  48.19 
 
 
202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.482837  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2057  hypothetical protein  45.79 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00270111  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1785  nitroreductase family protein  44.74 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000192884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1768  nitroreductase family protein  44.74 
 
 
199 aa  195  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000036137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1986  hypothetical protein  44.74 
 
 
200 aa  195  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10438e-46 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1811  hypothetical protein  46.67 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0479853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0278  putative nitroreductase family protein  44.74 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3444  hypothetical protein  44.74 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3191  hypothetical protein  44.74 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1951  hypothetical protein  46.67 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2494  nitroreductase  42.63 
 
 
199 aa  194  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.778298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2035  hypothetical protein  45.26 
 
 
199 aa  194  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3371  hypothetical protein  43.68 
 
 
200 aa  191  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154026  hitchhiker  4.547470000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2305  oxidoreductase related to nitroreductase-like protein  47.09 
 
 
203 aa  190  9e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000723605  normal  0.0201915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1957  hypothetical protein  45.56 
 
 
200 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0981647  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1745  oxidoreductase  45.36 
 
 
201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.573968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1819  nitroreductase  45.56 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000197539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1877  nitroreductase-like oxidoreductase  47.31 
 
 
200 aa  188  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1793  nitroreductase  45.83 
 
 
200 aa  188  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2024  hypothetical protein  46.35 
 
 
200 aa  187  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000571898  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1319  hypothetical protein  48.45 
 
 
200 aa  187  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000492984  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1017  nitroreductase  42.93 
 
 
199 aa  186  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1923  hypothetical protein  45.83 
 
 
200 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.89424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2908  nitroreductase  44.85 
 
 
202 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000982671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3420  hypothetical protein  45.83 
 
 
200 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1738  nitroreductase family protein  45.83 
 
 
200 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.137703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2003  hypothetical protein  45.83 
 
 
200 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.453289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1919  hypothetical protein  45.83 
 
 
200 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0270589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1955  hypothetical protein  45.83 
 
 
200 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000305608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1781  hypothetical protein  45.83 
 
 
200 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1760  nitroreductase family protein  46.28 
 
 
200 aa  184  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2184  oxidoreductase  46.67 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2107  hypothetical protein  44.68 
 
 
208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00257983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2070  hypothetical protein  44.68 
 
 
208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000267475  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01853  conserved hypothetical protein  40.3 
 
 
252 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3613  nitroreductase  40 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0720583  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02343  nitroreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09910)  38.94 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01800  conserved hypothetical protein  35.16 
 
 
210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02030  nitroreductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03530)  26.7 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485977  normal  0.398341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>