58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1777 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1777  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.482837  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1545  hypothetical protein  72.77 
 
 
202 aa  328  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.090911  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2305  oxidoreductase related to nitroreductase-like protein  69.31 
 
 
203 aa  311  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000723605  normal  0.0201915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2641  hypothetical protein  55.21 
 
 
200 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.868545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30800  hypothetical protein  54.17 
 
 
200 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0987437  hitchhiker  0.000000000186465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3529  hypothetical protein  54.45 
 
 
199 aa  224  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0433  hypothetical protein  54.45 
 
 
238 aa  222  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0497  hypothetical protein  54.45 
 
 
199 aa  222  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2978  nitroreductase  52.33 
 
 
199 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0278  putative nitroreductase family protein  51.31 
 
 
199 aa  222  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1768  nitroreductase family protein  51.83 
 
 
199 aa  220  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000036137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2057  hypothetical protein  51.31 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00270111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1986  hypothetical protein  51.83 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10438e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1785  nitroreductase family protein  51.31 
 
 
199 aa  218  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000192884  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0369  nitroreductase family protein  50.26 
 
 
199 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1819  nitroreductase  51.31 
 
 
199 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000197539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2035  hypothetical protein  50.79 
 
 
199 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1951  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1811  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0479853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3172  nitroreductase family protein  49.74 
 
 
199 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000372111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2494  nitroreductase  49.74 
 
 
199 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.778298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3410  hypothetical protein  49.74 
 
 
199 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3421  hypothetical protein  49.74 
 
 
199 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3099  nitroreductase family protein  49.74 
 
 
199 aa  215  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3400  hypothetical protein  49.74 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1957  hypothetical protein  50.26 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0981647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3191  hypothetical protein  48.68 
 
 
199 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3444  hypothetical protein  48.68 
 
 
199 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3371  hypothetical protein  49.74 
 
 
200 aa  208  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154026  hitchhiker  4.547470000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1017  nitroreductase  46.73 
 
 
199 aa  209  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2107  hypothetical protein  46.84 
 
 
208 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00257983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2070  hypothetical protein  46.84 
 
 
208 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000267475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1487  nitroreductase  51.81 
 
 
199 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1116  nitroreductase family protein  46.53 
 
 
201 aa  200  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169021  normal  0.724836 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1745  oxidoreductase  45.18 
 
 
201 aa  197  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.573968  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5017  hypothetical protein  48.19 
 
 
195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.998448  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2455  nitroreductase  49.74 
 
 
199 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01853  conserved hypothetical protein  43.28 
 
 
252 aa  191  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2908  nitroreductase  42.93 
 
 
202 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000982671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1793  nitroreductase  42.05 
 
 
200 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2105  hypothetical protein  49.48 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02343  nitroreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09910)  42.31 
 
 
222 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1877  nitroreductase-like oxidoreductase  45.11 
 
 
200 aa  177  7e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1319  hypothetical protein  42.11 
 
 
200 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000492984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3420  hypothetical protein  41.03 
 
 
200 aa  174  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1923  hypothetical protein  41.03 
 
 
200 aa  174  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.89424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1738  nitroreductase family protein  41.03 
 
 
200 aa  174  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.137703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1760  nitroreductase family protein  41.03 
 
 
200 aa  174  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2003  hypothetical protein  41.03 
 
 
200 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.453289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1919  hypothetical protein  41.03 
 
 
200 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0270589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1955  hypothetical protein  41.03 
 
 
200 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000305608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1781  hypothetical protein  41.03 
 
 
200 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2024  hypothetical protein  40.51 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000571898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2184  oxidoreductase  41.94 
 
 
202 aa  170  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1909  nitroreductase family protein  42.11 
 
 
204 aa  170  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3613  nitroreductase  38.22 
 
 
201 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0720583  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01800  conserved hypothetical protein  35.1 
 
 
210 aa  145  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02030  nitroreductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03530)  32.95 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485977  normal  0.398341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>