14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2206 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2206  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  154  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1573  hypothetical protein  58.67 
 
 		 74 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0225  hypothetical protein  58.67 
 
 		 74 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3055  hypothetical protein  58.67 
 
 		 74 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0684  protein of unknown function DUF1150  54.67 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3349  hypothetical protein  56.45 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0609  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0918378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0189  hypothetical protein  45.31 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.577781  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  40.26 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  37.14 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  35.9 
 
 		 85 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  36.23 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  35.38 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  34.29 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>