16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2185 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1025    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  34.11 
 
 
510 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  33.4 
 
 
492 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  33.47 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  31.84 
 
 
505 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  39.08 
 
 
376 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  27.29 
 
 
510 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  27.33 
 
 
476 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  28.98 
 
 
476 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  30.13 
 
 
568 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  26.28 
 
 
565 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  23.05 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  24.9 
 
 
614 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  22.18 
 
 
554 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  21.96 
 
 
535 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  21.22 
 
 
555 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>