23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0034 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0034  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  480  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0031  hypothetical protein  83.68 
 
 
239 aa  374  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00817392 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1073  hypothetical protein  82.77 
 
 
238 aa  375  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2148  hypothetical protein  83.61 
 
 
237 aa  375  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  32.91 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2273  hypothetical protein  29.58 
 
 
241 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222464  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1250  protein of unknown function DUF75  30.09 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  24.56 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  26.53 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  25.57 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  23.66 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  22.07 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  23.53 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  21.31 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  23.55 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  23.45 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  23.45 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  23.01 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  22.65 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3654  protein of unknown function DUF75  23.11 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  26.07 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1531  protein of unknown function DUF75  22.51 
 
 
246 aa  42  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.687731  normal  0.501878 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  46 
 
 
248 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>