24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5517 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  248  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  96 
 
 
125 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  48 
 
 
135 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  45.9 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  45.9 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  43.2 
 
 
133 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  35.82 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  32.32 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  31.67 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  31.36 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  31.36 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  30.77 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  30.77 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  29.27 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  31.93 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  28.21 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  31.67 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  27.64 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  27.64 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  29.31 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  29.17 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  27.27 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  27.05 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>