23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47589 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47589  predicted protein  100 
 
 
422 aa  871    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00364513  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42981  predicted protein  35.48 
 
 
559 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10281  serine/threonine protein phosphatase PPT1 (AFU_orthologue; AFUA_5G06700)  28.78 
 
 
497 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  25.52 
 
 
576 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10519  predicted protein  35.24 
 
 
110 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  30.1 
 
 
338 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31879  PP5/FYPP plant-like protein  25.62 
 
 
511 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0394948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.77 
 
 
3172 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94665  predicted protein  29.2 
 
 
570 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06840  phosphoprotein phosphatase, putative  24.83 
 
 
586 aa  46.6  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.66618  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45893  predicted protein  24.22 
 
 
565 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33202  predicted protein  35.44 
 
 
227 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241713  normal  0.439697 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00910  chaperone, putative  27.68 
 
 
584 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09124  heat shock protein (Sti1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01860)  30.25 
 
 
575 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32019  Heat Shock Protein 70, cytosolic  29.84 
 
 
711 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0878343 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33472  predicted protein  25.42 
 
 
170 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.403961  normal  0.102775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
486 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
280 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47258  predicted protein  21.95 
 
 
969 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32596  predicted protein  30.66 
 
 
365 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29097  predicted protein  30 
 
 
352 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  28.05 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26 
 
 
549 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>