14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21455 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21455  predicted protein  100 
 
 
815 aa  1706    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31402  predicted protein  38.77 
 
 
900 aa  520  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0818576  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73603  predicted protein  27.16 
 
 
693 aa  70.1  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.163855  normal  0.196096 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08874  dynamin-like GTPase Dnm1, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02840)  26.01 
 
 
794 aa  65.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362434  hitchhiker  0.000218966 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05070  dynamin GTPase, putative  27.83 
 
 
933 aa  65.1  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29011  predicted protein  29.81 
 
 
703 aa  62.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.453341  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01680  dynamin protein dnm1, putative  26.69 
 
 
832 aa  61.2  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05470  VpsA, putative  25.19 
 
 
694 aa  60.1  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01093  mitochondrial dynamin GTPase (Msp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11970)  26.07 
 
 
909 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28619  mitochondrial dynamin-like GTPase  26.92 
 
 
856 aa  58.9  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222715  normal  0.433771 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08023  Putative uncharacterized proteinVpsA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X230]  26.07 
 
 
696 aa  57.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0172951 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29756  predicted protein  24.51 
 
 
822 aa  54.3  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500789  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54751  predicted protein  27.56 
 
 
742 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  28.78 
 
 
599 aa  52  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>