37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0003 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  676    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  28.21 
 
 
343 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  26.9 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  28.21 
 
 
343 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  28.21 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  28.21 
 
 
343 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  28.21 
 
 
343 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  27.52 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  24.21 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  24.76 
 
 
352 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  31.14 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  25.51 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  23.77 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  25.91 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  31.69 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  23.88 
 
 
355 aa  60.1  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  25.17 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4191  hypothetical protein  28.03 
 
 
370 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2474  hypothetical protein  24.6 
 
 
315 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3041  hypothetical protein  26.23 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  24.1 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0873  acyltransferase 3  24.38 
 
 
376 aa  53.1  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.128696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2465  acyltransferase 3  23.18 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  25 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  26.79 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3111  acyltransferase 3  26.58 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360298  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  24.68 
 
 
331 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06310  hypothetical protein  29.84 
 
 
371 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0172  hypothetical protein  24.34 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000866641  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  28.21 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3645  hypothetical protein  24.28 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110018  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  24.35 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  23.91 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  23.91 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  23.91 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  24.03 
 
 
331 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  24.03 
 
 
331 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>