21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3078 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3078  CpcD phycobilisome linker domain protein  100 
 
 
78 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3042  CpcD phycobilisome linker domain protein  97.44 
 
 
78 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0157  CpcD phycobilisome linker domain protein  76.32 
 
 
79 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00508163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  61.04 
 
 
439 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  65.28 
 
 
440 aa  103  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  7.85266e-08 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1051  phycocyanin linker protein 9K  60.26 
 
 
81 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240621 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3486  CpcD phycobilisome linker domain-containing protein  70.13 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  62.32 
 
 
406 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  62.32 
 
 
406 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1693  CpcD phycobilisome linker domain protein  60 
 
 
76 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.268965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2933  CpcD phycobilisome linker-like  66.67 
 
 
80 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  55.41 
 
 
400 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  56.76 
 
 
403 aa  82.8  2e-15  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  2.02848e-06  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  54.93 
 
 
403 aa  80.5  8e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  57.14 
 
 
405 aa  75.1  3e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0581  hypothetical protein  46.77 
 
 
156 aa  60.1  9e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0564  hypothetical protein  46.77 
 
 
156 aa  60.1  9e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1761  hypothetical protein  41.67 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.381589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  43.33 
 
 
289 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  42.37 
 
 
286 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  46.55 
 
 
286 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>