24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1693 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1693  CpcD phycobilisome linker domain protein  100 
 
 
76 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.268965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  68.85 
 
 
440 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  70.49 
 
 
439 aa  90.5  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3486  CpcD phycobilisome linker domain-containing protein  73.68 
 
 
81 aa  90.1  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  66.13 
 
 
406 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  66.13 
 
 
406 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  58.57 
 
 
400 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3078  CpcD phycobilisome linker domain protein  60 
 
 
78 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  59.15 
 
 
403 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2933  CpcD phycobilisome linker-like  70.69 
 
 
80 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0157  CpcD phycobilisome linker domain protein  65.57 
 
 
79 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00508163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3042  CpcD phycobilisome linker domain protein  67.8 
 
 
78 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  53.33 
 
 
405 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1051  phycocyanin linker protein 9K  54.93 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240621 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  53.42 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0564  hypothetical protein  45.71 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0581  hypothetical protein  45.71 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  50 
 
 
286 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  43.86 
 
 
286 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  38.33 
 
 
289 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  35.59 
 
 
292 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1761  hypothetical protein  42.37 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.381589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  35.59 
 
 
292 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  32.2 
 
 
289 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.287731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>