22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_3486 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3486  CpcD phycobilisome linker domain-containing protein  100 
 
 
81 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2933  CpcD phycobilisome linker-like  84.81 
 
 
80 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3078  CpcD phycobilisome linker domain protein  70.13 
 
 
78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0157  CpcD phycobilisome linker domain protein  63.16 
 
 
79 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00508163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3042  CpcD phycobilisome linker domain protein  70.13 
 
 
78 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  59.74 
 
 
439 aa  94.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  64.38 
 
 
440 aa  94.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1693  CpcD phycobilisome linker domain protein  70.31 
 
 
76 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.268965 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1051  phycocyanin linker protein 9K  51.85 
 
 
81 aa  88.6  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  63.49 
 
 
400 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  55.56 
 
 
406 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  55.56 
 
 
406 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  56.72 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  52.7 
 
 
403 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  51.35 
 
 
405 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0564  hypothetical protein  48.44 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0581  hypothetical protein  48.44 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  41.27 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  37.97 
 
 
289 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1761  hypothetical protein  42.86 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.381589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  35.94 
 
 
286 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  33.8 
 
 
289 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.311002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>